董氏认为“治病必求其本”，以“脾胃为本”更为重要。《素问·玉机真藏论》云：“五脏者，皆禀气于胃，胃者五脏之本也。”吴澄《不居集》云：“故凡查病者，必先查脾胃强弱，治病者必先顾脾胃勇怯，脾胃无损，诸可无虑。梦李东垣云：“诸病从脾胃而生。”董氏善于运用脏腑学说，指导临床实践，而尤重视脾胃对人体生理病理之重要作用。尝谓：“脾胃为脏腑之本。胃主受纳，脾主运化，化生气血津液以养五脏六腑，脾胃健则五脏安，故医者审病不可不察脾胃之虚实。譬如《伤寒论》232条：若不尿，腹满加哕者，不治’，332条：‘凡厥利者，当不能食，今反能食者，恐为除中。食以索饼，不发热者，知胃气尚在，必愈'等条文，均为察胃气断预后之明证。又小柴胡汤之'和'，其真谛在于‘和胃气和则少阳藉其达邪外出，仲景谓：“胃和则愈，胃不和，烦而悸'(《伤寒论》265条)即是此意。伤寒、温病有伤阴伤阳之别，其治有救阴救阳之异，然‘和胃气'则相同。内伤杂证亦应以胃气为本”。故临证之时，董氏首重胃气，每于疑难大症，而收佳效。忆50年代末，曾治一重症肌无力女性患者，罹病两年，服滋肝补肾之品不下百余剂，未见起色。经友人介绍由沈阳来津求治。病者语声低微，眼睑下垂，咀嚼吞咽困难，周身软弱无力，舌淡苔白厚腻，生活难以自理。董氏认定系由中气虚衰所致，予参苓白术散佐通经活络之品，方药仅十几味，且用量很轻，一剂不过两(注，合今之30克)许。或疑药力轻薄难以胜病，疑而询之，董谓：“虚损久疾，益肝肾不如调脾胃。夫药饵入于胃，俟脾运化以布四肢，设脾胃虚惫而蛮投滋补滞腻，则无力以运药，观其厚腻之苔即可知。病既久，其来渐，去亦缓，用药量宜轻。若施重剂必有碍脾胃之运化，欲速则不达也。”黄坤载云：“中气一败，堤防崩溃。”(《伤寒悬解》)医者当引以为戒。患者服药后又酌加黄芪、冬虫草等补肺气之品，年余竟获愈，生活可自理，行动如常而归故里。又如李姓某，年过六旬，于1964年孟春患血淋，延医数人，凉血、固涩、健脾、补肾之剂遍尝，势不减，于同年季秋登门求诊。切脉细软无力，舌质淡，舌中薄黄腻苔。断其脾胃虚弱而兼中焦湿热之证。先予五苓散十余剂，黄苔消退。继之以补中益气汤治疗，十余剂而收功。董氏谓：“脾胃气虚而挟湿热者，切莫苦寒清泄。否则，伤损脾胃，凝涩血脉，血愈难止。诚如缪仲淳所云：.......寒凉之剂，反伤胃气，胃气伤则脾不能统血，血愈不能归经矣'(《先醒斋医学广笔记》)。用五苓散妙在桂枝一味，通阳化气，温而行之，乃反佐之意。补中益气汤是益气而摄血。”
